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几近完整的高质量草莓参照基因组公开

2019-07-31 09:00:33 草莓

原题目:几近完整的高质量草莓参照基因组公开

据英国《自然·遗传学》杂志2月25日在线刊登的一项研究,美国科学研究家汇报了一个几近完整的草莓参照基因组。该高质量基因组不光为知道草莓起源和演化历史提供了新看法,还对今后改进其品种及提高抗病性大有助力。

八倍体栽培种草莓卡姆罗莎有8组染色体,也被称为花苑草莓,因其味美芬芳而深受喜爱。

本次,美国密歇根州立大学研究人员帕德里克·艾德格及其同事,对该八倍体草莓的基因组发起了高质量组装和批注,共评定出10万多个草莓基因。研究团队对草莓属二倍体种(拥有两组染色体的草莓品种)的31组RNA分子发起了测序,并将二倍体种的解释基因序列与八倍体栽培种草莓的解释基因序列发起了比照。

研究团队随后通过演化剖析,评定出了森林草莓、饭沼草莓以及此前未知的绿色草莓和日本草莓,是八倍体栽培种草莓的4个二倍体祖先种。该剖析融合现存种的地理分布还能够阐明,八倍体草莓起发源北美。

此外,团队还对八倍体草莓的4个亚基因组开展了演化驱动力学剖析,他们发现了一个占支配地位的亚基因组,能在很大水平上控制草莓的分泌和抗病性状。

研究人员总结表示,草莓的演化和起源信息、占主导地位的亚基因组,以及首个八倍体草莓高质量基因组,今后能当作研究人员和育种者改进栽培种花苑草莓口感、香味和提高抗病性的有利资源。


(责编:郭扬、吴楠)

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